Pokud používáme modul Mzdy, je vhodné mít ve Flexi mzdy vypočtené pro celé roční období.
​
Získáme tím kompletní mzdové listy, průběžný výpočet průměrných výdělků, podklady pro roční zúčtování daně z příjmu ze závislé činnosti. Proto nedoporučujeme začít používat modul Mzdy pouze pro část období.