Ak používate modul Mzdy, je vhodné nechať si vypočítať mzdy vo Flexi za celý rok.
​
Takto získate kompletnú mzdovú agendu, priebežný výpočet priemerného zárobku a podklady pre ročné zúčtovanie dane z príjmov. Preto sa neodporúča začať používať modul Mzdy len na časť obdobia.