Získaný certifikát nahrajeme do Flexi v menu Nástroje - EET Certifikáty. Klikneme na Nový a vybereme soubor s certifikátem z počítače. Certifikát by měl mít příponu .p12. Dále vyplníme pole Provozovna. (většinou bývá označena dvouciferným číslem)
Certifikát nahrajeme přes tlačítko “Dokončit”. Zde nás může systém vyzvat k zadání hesla, pokud je certifikát zaheslovaný.
V menu Nástroje - Certifikáty také ověřujeme platnost daného certifikátu. Pozor! Certifikát vidí pouze uživatel, který ho nahrál, jedině tento uživatel proto může kontrolovat jeho platnost.