URL musí být zakódováno, jak je uvedeno zde https://www.flexibee.eu/api/dokumentace/ref/filters
"Filtry musí být v URL správně zakódovány. Při ruční tvorbě filtru jej stačí napsat nezakódovaný v prohlížeči Firefox. Když jej pak zkopírujete do schránky, Firefox jej překóduje."
Příkaz by tedy měl vypadat takto, bez mezer (případně je také překódovat "%20"):
curl -u winstrom:winstrom -k -L -f "https://demo.flexibee.eu/c/demo/faktura-vydana/(datSplat%3Enow()).xml" -o ds.xml