Niektoré banky používajú jeden účet, ale vedú ho v rôznych menách (napr. Raiffeisenbank). Na túto možnosť je systém Flexi pripravený – musíte mať v zozname bankových účtov (menu Peniaze - Banka) tento účet zadaný 2x.
Rozdiel bude pri vypĺňaní na záložke Informácie o banke – položka Mena banky a v niektorých prípadoch je nutné na záložke Elektronická banka - použiť iný Formát sťahovaných výpisov a príkazov.
Zároveň je potrebné mať pre každý z týchto účtov samostatný adresár vo Vašom počítači.